Городу нужны герои. Шреддер и подвластный ему клан Фут держат Нью-Йорк железной хваткой, контролируя всё — от полиции до политиков.

Будущее кажется беспросветным, пока четверо невероятных братьев не появляются из канализации в образе Черепашек-Ниндзя.

Их верными союзниками становятся бесстрашная журналистка Эйприл О'Нил и ее саркастичный оператор Верн Фенвик. Вместе им предстоит спасать город и распутывать дьявольский план Шреддера.